Đúng là màu của cái chất tương ứng là sự chuyển dịch cách điện tử giữa từ HOMO lên LUMO , tuy nhiên với nhưng phân tử cấu trúc phức tạp đặc biệt là khi trong cấu trúc có nhiều hệ liên hợp độc lập thì xây dựng giản đồ MO ko đơn giản tẹo nào.
Với cấu trúc phân tử nhiều hệ liên hợp độc lập thì theo FMO sẽ ứng với nhiều chuyển mức năng lượng khả quan với tần xuất cao. chính vì thế gây ra các pic màu khác nhau, điều này dễ tấy trong phổ UV-Vis. Cụ thể là có các píc độc lập hoặc chồng chéo lên nhau, khi ấy màu tao thấy được là màu của tổ hợp các màu của các pic ấy gây ra . Nên được gọi là màu "không tinh khiết". Màu sắc của màu ko tinh khết thường có thẩm, không tươi.
Với cấu trúc phân tử chỉ gồm một hệ liên hợp thì việc xây dựng giản đồ MO đơn giản hơn, và thường thì chuyển mức năng lựong ứng với ánh sáng nhìn thấy chỉ có 1 píc nên màu màuấy gọi là màu tinh khiết. Màu thường rất tươi.
Trên đọan phim trên, nhìn màu sắc của trường hợp Benzaldehyde thì màu thẩm hơp rất rõ, có thể là sự tổ hợp của màu vàng và màu đỏ. Hai hệ liên hợp này bắt nguồn từ nguyên tử N số 1.
Tiệp đây có 1 bài tập tổng hợp phần hóa màu hợp chất azo, anh em ngâm cuối tuần.